ГЦМО ЭМС создан в соответствии с распоряжением Совета Министров СССР от 4 февраля 1989 г. № 197-рс «О создании государственной системы обеспечения электромагнитной совместимости». Цель создания ГЦМО ЭМС – обеспечение координации организаций различных отраслей и профессиональная деятельность в области электромагнитной совместимости (ЭМС) по основным направлениям.